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除草劑可按作用方式、施藥部位、化合物來源等多方面分類。根據除草劑的作用特性，通常將其分成芽前除草劑、苗后除草劑兩大類。
芽前除草劑也稱土壤處理除草劑。這類除草劑只能在雜草萌芽出苗前或出苗期間使用，如在雜革出苗后使用則對雜草基本無效。在綠葉菜生產中，一般在綠葉菜種植前、播種后出苗前（播后苗前）或綠葉菜生長期而雜草處于萌芽期時作土壤噴霧處理。二甲戊靈、敵草胺等均為芽前除草劑。苗后除草劑苗后除草劑也稱莖葉處理除草劑。這類除草劑通常在雜草出苗后的營養生長旺盛期使用，對土壤中還沒有萌發的雜草基本無效。在綠葉菜生產中，一般在綠葉菜生長期作莖葉噴霧處理。精吡氟禾草靈、滅草松等。
根據作用方式分類
（1）選擇性除草劑：除草劑對不同種類的苗木，抗性程度也不同，此藥劑可以殺死雜草，而對苗木無害。如蓋草能、氟樂靈、撲草凈、西瑪津、果爾除草劑等。
（2）滅生性除草劑：除草劑對所有植物都有毒性，只要接觸綠色部分，不分苗木和雜草，都會受害或被殺死。主要在播種前、播種后出苗前、苗圃主副道上使用。如草甘膦等。
根據除草劑在植物體內的移動情況分類
（1）觸殺型除草劑：藥劑與雜草接觸時，只殺死與藥劑接觸的部分，起到局部的殺傷作用，植物體內不能傳導。只能殺死雜草的地上部分，對雜草的地下部分或有地下莖的多年生深根性雜草，則效果較差。如除草醚、百草枯等。
（2）內吸傳導型除草劑：藥劑被根系或葉片、芽鞘或莖部吸收后，傳導到植物體內，使植物死亡。如草甘膦、撲草凈等。
（3）內吸傳導、觸殺綜合型除草劑：具有內吸傳導、觸殺型雙重功能，如殺草胺等。
根據化學結構分類
（1）無機化合物除草劑：由天然礦物原料組成，不含有碳素的化合物，如氯酸鉀、硫酸銅等。
（2）有機化合物除草劑：主要由苯、醇、脂肪酸、有機胺等有機化合物合成。如醚類——果爾、均三氮苯類——撲草凈、取代脲類——除草劑一號、苯氧乙酸類——2甲4氯、吡啶類——蓋草能、二硝基苯胺類——氟樂靈、酰胺類——拉索、有機磷類——草甘膦、酚類——五氯酚鈉等。
按使用方法分類
（1）莖葉處理劑：將除草劑溶液兌水，以細小的霧滴均勻的噴灑在植株上，這種噴灑法使用的除草劑叫莖葉處理劑，如蓋草能、草甘膦等。
（2）土壤處理劑：將除草劑均勻地噴灑到土壤上形在一定厚度的藥層，當雜草種子的幼芽、幼苗及其根系被接觸吸收而起到殺草作用，這種作用的除草劑，叫土壤處理劑，如西瑪津、撲草凈、氟樂靈等，可采用噴霧法、澆灑法、毒土法施用。
（3）莖葉、土壤處理劑：可作莖葉處理，也可作土壤處理，如阿特拉津等。
